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RNA 定量的最佳技術(shù)介紹

更新時間:2023-10-31      點擊次數(shù):797

RNA 和 DNA 定量(有時稱為核酸定量)可確定給定樣品中 RNA 或 DNA 的濃度。定量過程的一部分可能涉及處理混合物樣品,可能含有多種污染物,例如蛋白質(zhì)、其他核酸或有機化合物。

什么是RNA定量?

有多種實驗方法可用于 RNA 定量。其中包括用于 RNA 定量、熒光或分光光度測量的 PCR 方法。 

用于RNA 定量的分光光度法和熒光法比 PCR 等方法具有多個優(yōu)勢。使用光學方法進行 RNA 定量不需要任何額外的樣品制備,非常經(jīng)濟高效且耗時較少。雖然基于 PCR 的方法可以提供良好的靈敏度,但它們更復雜且執(zhí)行成本更高,并且只有極低 RNA 濃度的 RNA 定量才需要這種水平的靈敏度。 

分光光度法和熒光分析

分光光度測量提供了一種穩(wěn)健且直接的 RNA 定量方法。RNA 定量通常在 260 nm 下進行,同時還會收集 UV 范圍內(nèi)的一系列波長。大多數(shù)蛋白質(zhì)、小有機分子和核酸在該區(qū)域具有很強的吸收和發(fā)射特征,從而可以對 RNA 進行定量并識別潛在污染物。

在已知光程下測量的樣品吸光度與該樣品的濃度成正比。在特定波長(RNA 為 260 nm)下透過樣品的光量可用于 Beer-Lambert 方程來計算感興趣樣品的濃度,在本例中用于 RNA 定量。還必須知道感興趣物種的摩爾吸收系數(shù)。

計算摩爾吸收系數(shù)相對簡單。由于給定波長下的吸光度和光程之間的關(guān)系與濃度成線性比例,因此可以測量參考樣品的一系列給定稀釋度。通過對這些數(shù)據(jù)點進行線性擬合,可以計算摩爾吸收系數(shù)并用于將來的量化。對于 DNA 和 RNA 等充分表征的樣品,系數(shù)是已知的并包含在分析軟件中。 

RNA 定量也可以通過熒光測量來進行熒光測量比基于吸光度的測量具有更高的靈敏度。已經(jīng)開發(fā)出專為激發(fā)感興趣的分析物而開發(fā)的檢測試劑盒。即使在復雜混合物或存在污染物的情況下,這些也可用于 RNA 定量。樣品的熒光量也與濃度成正比,并且可以通過使用已知濃度的類似樣品的標準曲線來定量。 

用于 RNA 定量的分光光度計

DeNovix 是生物技術(shù)專家,擁有多種針對 RNA 定量進行優(yōu)化的儀器,包括 DS-11 系列和 QFX 熒光計,這些儀器在設(shè)計時考慮了 RNA 定量的一些復雜性。

QFX 熒光計具有出色的靈敏度和特異性,適用于可能涉及高度復雜的混合物或需要在極低濃度下進行 RNA 定量的挑戰(zhàn)性 RNA 定量情況。它配備了四個光源和帶有敏感光電二極管的發(fā)射通道,所有這些都可以選擇用于藥理學應用的安全審計跟蹤記錄。 

DS -11 系列是一款適用于常規(guī)樣品和珍貴樣品的微量儀器。DS-11 可以處理小至一微升的體積,并在最寬的可用動態(tài)范圍內(nèi)進行定量。DS-11 還配備了易于使用的軟件,可以顯示全光譜掃描以及通常用作 RNA 定量和質(zhì)量控制一部分的 260/280 和 260/230 比率。


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